Учебный центр ведет в установленном порядке управленческий, статистический учет и отчетность, контролирует правильность и достоверность содержащихся в них сведений, обеспечивает проведение мероприятий по их автоматизации, представляет на утверждение Учреждению отчетность Учебного центра.

    Учебный центр по месту нахождения не имеет лицевого счета в территориальных органах Федерального Казначейства. Бухгалтерская и статистическая отчетность Учебного центра ведется централизованной в Якутском районе водных путей и судоходства - филиале ФБУ «Администрация Ленского бассейна» и входит в баланс Якутского района водных путей и судоходства- филиала ФБУ «Администрация Ленского бассейна».